Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1eQ61290 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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