Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim2Q61079 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms