Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms