Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms