Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms