Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PtprnQ60673 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprnQ60673 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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