Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms