Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms