Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms