Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms