Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp18Q5SSI6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms