Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms