Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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