Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms