Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms