Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Q5EBG8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q5EBG8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms