Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Fam208bQ5DTT3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Fam208bQ5DTT3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms