Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms