Protein–RNA interactions for Protein: Q505F1

Nr2c1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2c1Q505F1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2c1Q505F1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms