Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms