Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms