Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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