Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms