Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pacs2Q3V3Q7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pacs2Q3V3Q7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pacs2Q3V3Q7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pacs2Q3V3Q7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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