Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms