Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms