Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc185Q3V118 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms