Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms