Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

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Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Dnah12Q3V0Q1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms