Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Kdm5aQ3UXZ9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Kdm5aQ3UXZ9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Kdm5aQ3UXZ9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Kdm5aQ3UXZ9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Kdm5aQ3UXZ9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
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Kdm5aQ3UXZ9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Kdm5aQ3UXZ9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Kdm5aQ3UXZ9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Kdm5aQ3UXZ9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm5aQ3UXZ9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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