Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upf3aQ3ULJ3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms