Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms