Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms