Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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