Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Otud5Q3U2S4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Otud5Q3U2S4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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