Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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