Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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