Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms