Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms