Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms