Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms