Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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