Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms