Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms