Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam178bQ24JP3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms