Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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