Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms