Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms