Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms