Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83bQ0VBM2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83bQ0VBM2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms